Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms