Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms