Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04213 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04213 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04213 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04213 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04213 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04213 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04213 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04213 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04213 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04213 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04213 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04213 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04213 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04213 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04213 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04213 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04213 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04213 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04213 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04213 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04213 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P04213 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04213 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04213 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms