Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms