Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01852 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01852 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01852 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01852 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01852 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01852 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01852 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01852 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01852 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01852 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01852 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01852 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01852 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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