Protein–RNA interactions for Protein: P01819

Ig heavy chain V region MOPC 141, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01819 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01819 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01819 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01819 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01819 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms