Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01738 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01738 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms