Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01673 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01673 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01673 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01673 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01673 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01673 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01673 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01673 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01673 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01673 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms