Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01668 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01668 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01668 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01668 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01668 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01668 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01668 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01668 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01668 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01668 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01668 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms