Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gnpda1O88958 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms