Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
CntfrO88507 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CntfrO88507 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CntfrO88507 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CntfrO88507 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CntfrO88507 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CntfrO88507 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CntfrO88507 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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