Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms