Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AvilO88398 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AvilO88398 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms