Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt1O88346 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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