Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtssO70370 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtssO70370 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtssO70370 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtssO70370 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtssO70370 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtssO70370 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtssO70370 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtssO70370 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtssO70370 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtssO70370 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms