Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms