Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lgals6O54891 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms