Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limk2O54785 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms