Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms