Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc27a2O35488 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms