Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms