Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Slc16a8O35308 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc16a8O35308 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc16a8O35308 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc16a8O35308 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc16a8O35308 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc16a8O35308 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc16a8O35308 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc16a8O35308 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms