Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfrsf11aO35305 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf11aO35305 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms