Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms