Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnk3O35111 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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