Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gcm2O09102 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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