Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms