Protein–RNA interactions for Protein: O08796

Eef2k, Eukaryotic elongation factor 2 kinase, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef2kO08796 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef2kO08796 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms