Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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