Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700122O11RikJ3QPW6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms