Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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