Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm9602J3QPD5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm9602J3QPD5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm9602J3QPD5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms