Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms