Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms