Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c2J3QNM1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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