Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm6408J3QNG1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm6408J3QNG1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm6408J3QNG1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm6408J3QNG1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm6408J3QNG1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm6408J3QNG1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6408J3QNG1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm6408J3QNG1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm6408J3QNG1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms