Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp616J3QN14 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp616J3QN14 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms