Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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