Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms