Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms