Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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