Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms