Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms