Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer4cG3UXD1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4cG3UXD1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms