Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r39G3UWE6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms