Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r85G3UW56 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r85G3UW56 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms