Protein–RNA interactions for Protein: F7CXE4

Gm7535, Predicted gene 7535, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7535F7CXE4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7535F7CXE4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7535F7CXE4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7535F7CXE4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms