Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21977F6U3N7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms