Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms