Protein–RNA interactions for Protein: E9QAB6

Ptar1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptar1E9QAB6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptar1E9QAB6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptar1E9QAB6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptar1E9QAB6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptar1E9QAB6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms